109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1420 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  43.8 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  42.34 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  40.34 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  37.7 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  39.83 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  37.72 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  34.92 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  34.92 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  34.55 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.43 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  40.54 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  35.04 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  40.95 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  35.14 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.78 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  35.34 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  35.34 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  34.68 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.61 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  27.56 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  37.07 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.87 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  38.26 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  32.2 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  29.13 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  27.42 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  34.23 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  22.96 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.04 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.04 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.04 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.04 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.04 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.04 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  22.22 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  24.22 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.04 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.91 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  26.23 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.04 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.83 
 
 		 779 aa  52  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  23.77 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  39.74 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  39.74 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  22.69 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3052  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129112  normal  0.291698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  27.2 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1446  hemerythrin-like metal-binding protein  36.7 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0899389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  23.14 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  36 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.73 
 
 		 689 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  23.44 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  21.49 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  27.05 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  31.97 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  32.76 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.66 
 
 		 997 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  28.23 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.83 
 
 		 722 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  27.05 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  24.81 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  21.09 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  22.95 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  25.42 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  25 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  31.2 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  28.69 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  20.54 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  26.98 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  27.48 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  25.93 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.32 
 
 		 529 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.32 
 
 		 529 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.32 
 
 		 529 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.32 
 
 		 529 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  27.2 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.41 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  20.77 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 559 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.4 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.69 
 
 		 530 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  30.89 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0083  hypothetical protein  25.84 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.15 
 
 		 963 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 146 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1768  hemerythrin-like metal-binding protein  26.67 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  22.76 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0400  response regulator receiver protein  21.37 
 
 		 320 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.401585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 926 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  26.98 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  21.19 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>