54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1446 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1446  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 143 aa  295  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0899389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  39.26 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  40.3 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  39.26 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1450  hemerythrin-like metal-binding protein  29.13 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000266024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3052  hemerythrin-like metal-binding protein  29.86 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129112  normal  0.291698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  33.08 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  33.08 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.54 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1768  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  29.92 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  21.64 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  31.06 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  31.82 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  36.7 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  26.83 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  27.37 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  25.37 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  26.4 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  31.82 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  26.87 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.13 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  25.81 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  30.77 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  25.19 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  25.89 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  26.89 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  27.07 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 		 1032 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  30.86 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  30.53 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  30.59 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  26.87 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  28.93 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.08 
 
 		 529 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.79 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  32.14 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  21.97 
 
 		 138 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  27.27 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.76 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  27.12 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.31 
 
 		 529 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  23.08 
 
 		 529 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  22.48 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.1 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  29.77 
 
 		 144 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  25.96 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>