45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2637 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  100 
 
 		 160 aa  332  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  68.87 
 
 		 157 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  46.81 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  43.87 
 
 		 186 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  44.3 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  44.3 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  44.3 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  44.68 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  44.68 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  44.68 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.22 
 
 		 138 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  39.39 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.09 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  38.46 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  35.61 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  36.24 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  35.29 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.71 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  33.09 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  34.15 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  32.52 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  31.45 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  28.46 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  33.87 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  30.71 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  30.71 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  29.37 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  31.58 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  32.28 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  28.26 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  30.12 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  32.52 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  29.17 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  28.23 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  26.77 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1768  hemerythrin-like metal-binding protein  29.52 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2231  hemerythrin-like metal-binding protein  23.2 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.29139  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3235  hemerythrin-like metal-binding protein  27.15 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.6093  normal  0.294048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.63 
 
 		 768 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  24.82 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  22.9 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  27.34 
 
 		 192 aa  40.8  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>