41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3235 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3235  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 174 aa  357  6e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.6093  normal  0.294048 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0606  GGDEF family protein  29.94 
 
 		 385 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.369805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  27.78 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.93 
 
 		 927 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0841  GGDEF family protein  25.88 
 
 		 372 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  31.03 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  27.97 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  28.97 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  31.47 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  27.7 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  29.25 
 
 		 133 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  26.97 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  22.35 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  26.97 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  28.67 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  35.63 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.66 
 
 		 515 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.54 
 
 		 779 aa  45.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.46 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  24.5 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  29.09 
 
 		 90 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  28.17 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1354  GGDEF family protein  25.42 
 
 		 368 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 515 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  27.15 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 615 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  27.56 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  33.1 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 722 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.97 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  26.95 
 
 		 140 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  26.06 
 
 		 681 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  30.28 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  28.17 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  26.21 
 
 		 470 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 143 aa  41.2  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  24.26 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.13 
 
 		 135 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  23.81 
 
 		 131 aa  40.8  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 		 518 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>