110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1625 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 160 aa  330  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  42.94 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  40.12 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  41.1 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  41.1 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  41.25 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.42 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.69 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.13 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.13 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.97 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.13 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.13 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.13 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.13 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.13 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.29 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  34.97 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  35 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.04 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.56 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  32.64 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.1 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  35.48 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  40 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  35.48 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  29.27 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  31.3 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  36.07 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.67 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  28.57 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  24.63 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  33.87 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  33.87 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 736 aa  60.8  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  26.56 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  31.53 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  22.39 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  37.5 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 		 963 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  34.23 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  24.41 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  30.5 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  29.79 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24 
 
 		 927 aa  54.3  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  22.76 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  22.13 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  26.56 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.59 
 
 		 529 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  33.07 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.87 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.31 
 
 		 529 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.31 
 
 		 529 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.31 
 
 		 529 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.31 
 
 		 529 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.95 
 
 		 526 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 		 518 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.19 
 
 		 963 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  24.49 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  26.02 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  24.6 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  21.71 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.95 
 
 		 529 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  28.46 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  22.73 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  28.05 
 
 		 498 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  29.77 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.95 
 
 		 529 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  20.49 
 
 		 145 aa  47.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  21.01 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2752  hemerythrin-like metal-binding protein  25.69 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.976413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  22.14 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.74 
 
 		 722 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  24.81 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  22.58 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  22.95 
 
 		 529 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.36 
 
 		 515 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.38 
 
 		 941 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1450  hemerythrin-like metal-binding protein  23.93 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000266024  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  25.87 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.63 
 
 		 515 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  25.37 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  26.98 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  27.43 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  27.61 
 
 		 133 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  27.61 
 
 		 133 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  26.98 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  25.38 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  24.82 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  28.41 
 
 		 631 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  22 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  23.31 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2255  hemerythrin-like metal-binding protein  23.61 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547247  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  24.62 
 
 		 146 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.14 
 
 		 994 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>