179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1401 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 
146 aa  295  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  73.94 
 
 
155 aa  217  5e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  48.23 
 
 
157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  43.88 
 
 
151 aa  110  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  37.88 
 
 
137 aa  98.2  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.92 
 
 
518 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 
518 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  32.85 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  31.85 
 
 
188 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  34.38 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.61 
 
 
559 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  32.33 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.12 
 
 
515 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  34.65 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 
722 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  28.79 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.12 
 
 
515 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  31.34 
 
 
615 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0298  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.69 
 
 
749 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  31.54 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.52 
 
 
689 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
963 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  25.93 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  27.56 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  28.35 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.35 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 
526 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  28.06 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  28.06 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  24.26 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  27.66 
 
 
161 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  31.75 
 
 
470 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  27.01 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  29.84 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  28.06 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  30.43 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.13 
 
 
994 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.87 
 
 
941 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  30.22 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.69 
 
 
779 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.77 
 
 
529 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  32.84 
 
 
667 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  25.55 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.77 
 
 
529 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  31.01 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.77 
 
 
529 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0297  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.23 
 
 
753 aa  63.5  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.56 
 
 
927 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  30.37 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 
529 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 
529 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 
529 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  26.21 
 
 
368 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  26.95 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 
529 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  25.4 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.19 
 
 
997 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  31.15 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  24.41 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  29.1 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.48 
 
 
530 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  28.91 
 
 
529 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  26.12 
 
 
681 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 
518 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  29.41 
 
 
213 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  27.56 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  23.36 
 
 
871 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.91 
 
 
926 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  26.87 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0253  hemerythrin  30.3 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  29.13 
 
 
145 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  29.55 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  26.72 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.82 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 
963 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  29.63 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.37 
 
 
1004 aa  55.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  23.02 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  31.5 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  26.47 
 
 
360 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  29.1 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.19 
 
 
579 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  23.45 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.98 
 
 
1032 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  22.96 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  25.93 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  27.14 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  29.1 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0275  diguanylate cyclase  24.06 
 
 
630 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  29.63 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>