143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0777 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  100 
 
 		 137 aa  276  9e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  80.3 
 
 		 138 aa  218  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  79.55 
 
 		 138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  51.67 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  41.67 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  48.46 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.09 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  39.37 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  39.23 
 
 		 168 aa  94.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  38.46 
 
 		 168 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  36.29 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  40.48 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  43.1 
 
 		 186 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  43.1 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  43.1 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  43.1 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  37.69 
 
 		 166 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  43.1 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  43.1 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  43.1 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  43.97 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  39.23 
 
 		 171 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  34.92 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  37.3 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  34.92 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  34.56 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  35.38 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  33.07 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  34.43 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  33.08 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  33.87 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  34.43 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  37.07 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  24.06 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  25.56 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  24.81 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  21.8 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  25.56 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  24.06 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  27.82 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  36.51 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  25.76 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  26.15 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  30.08 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2568  hemerythrin-like metal-binding protein  24.63 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00123244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  23.31 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  24.63 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  27.13 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  22.56 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  32.77 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  25.21 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1660  hemerythrin HHE cation binding region  27.35 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  20.74 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 736 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2564  hemerythrin-like metal-binding protein  23.88 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.059586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.77 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  29.27 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  31.4 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  31.4 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 		 779 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  29.91 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3052  hemerythrin-like metal-binding protein  30.43 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129112  normal  0.291698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  25.95 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  25.95 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2231  hemerythrin-like metal-binding protein  24.59 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.29139  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  25.55 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  22.22 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.43 
 
 		 994 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  25.38 
 
 		 871 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  22.76 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  20.49 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  21.32 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  25.6 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.73 
 
 		 518 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  24.62 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  21.95 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.02 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  19.64 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  25.41 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  25.19 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.64 
 
 		 941 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  28.33 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  22.31 
 
 		 360 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  28.33 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.08 
 
 		 579 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0520  hemerythrin-like metal-binding protein  29.75 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0492  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.58 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  23.2 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  23.48 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  26.87 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0525  hemerythrin-like metal-binding protein  29.75 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  25.56 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.79 
 
 		 530 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  23.58 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>