118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2762 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 146 aa  296  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  71.63 
 
 		 147 aa  186  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  64.08 
 
 		 146 aa  181  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  58.27 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  44.06 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  47.48 
 
 		 166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  44.68 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  47.14 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  47.14 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  47.52 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  43.66 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  46.85 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  40.58 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  48.85 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  39.37 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.76 
 
 		 138 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.76 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  39.5 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  39.5 
 
 		 168 aa  88.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  36.21 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  32.64 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  37.7 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  35.51 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.46 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.12 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.52 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  33.62 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  31.45 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  26.61 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  31.54 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  25.4 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.87 
 
 		 722 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.94 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.94 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.94 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.94 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.94 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.94 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.94 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  24.59 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  22.76 
 
 		 199 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  22.76 
 
 		 199 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.11 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  26.19 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  25.62 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  20.71 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  25.19 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  23.68 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  26.05 
 
 		 277 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  24.41 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  20.63 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0520  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 143 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0492  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.93 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  23.58 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  26.92 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0525  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  23.81 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  26.15 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  25.55 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  30.53 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  25.2 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  25.98 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  23.73 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.39 
 
 		 779 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  25.37 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  25.4 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  30.71 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  23.02 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  23.58 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1354  GGDEF family protein  22.3 
 
 		 368 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1446  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0899389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.5 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.83 
 
 		 941 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  20 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  30.95 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  27.2 
 
 		 188 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0858  hemerythrin-like metal-binding protein  27.94 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  32.52 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  23.81 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  23.08 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.87 
 
 		 927 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.87 
 
 		 526 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0841  GGDEF family protein  32.14 
 
 		 372 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214515  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.2 
 
 		 963 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  27.69 
 
 		 681 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  22.05 
 
 		 667 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  25.2 
 
 		 736 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.5 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  23.7 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.07 
 
 		 768 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  23.88 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  23.88 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 		 518 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>