169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1106 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  59.07 
 
 		 199 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  59.07 
 
 		 199 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  48.66 
 
 		 183 aa  168  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1104  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  57.89 
 
 		 98 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  37.86 
 
 		 141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0044  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0109  hypothetical protein  50.62 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0083  hypothetical protein  32.31 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0266  hypothetical protein  31.2 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  29.03 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  29.13 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  30.16 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  26.05 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  34.88 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  29.37 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  29.93 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  33.33 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  33.33 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  34.71 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 		 518 aa  62  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  33.61 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  27.13 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  29.6 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  27.13 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  29.03 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  27.59 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  31.09 
 
 		 871 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.64 
 
 		 529 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  24.17 
 
 		 529 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  24.22 
 
 		 631 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.13 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  26.61 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  29.71 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 529 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 529 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 529 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 529 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.95 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  32.81 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.27 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.27 
 
 		 515 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  30.71 
 
 		 130 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 		 530 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.17 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  26.17 
 
 		 667 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  24.03 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  27.33 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0400  response regulator receiver protein  28.07 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.401585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.07 
 
 		 963 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  28.21 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0858  hemerythrin-like metal-binding protein  23.85 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  29.1 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  31.2 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.34 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  29.92 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3118  hemerythrin-like metal-binding protein  34.21 
 
 		 129 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  28.81 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  24.14 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1406  hemerythrin  27.27 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.039713  normal  0.0262691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  27.73 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  26.05 
 
 		 498 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  28.45 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 927 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  23.62 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  31.75 
 
 		 519 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  25.86 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  27.61 
 
 		 470 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  26.61 
 
 		 129 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  29.41 
 
 		 145 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  29.66 
 
 		 131 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  32.63 
 
 		 134 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  21.77 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.22 
 
 		 518 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  25.81 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  23.2 
 
 		 133 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.68 
 
 		 518 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1523  hemerythrin  25.3 
 
 		 262 aa  51.2  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 129 aa  51.2  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  25.58 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  25.87 
 
 		 368 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  25.79 
 
 		 722 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.77 
 
 		 963 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  27.64 
 
 		 135 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  21.88 
 
 		 133 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>