104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1104 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1104  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  56.84 
 
 		 199 aa  117  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  56.84 
 
 		 199 aa  117  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  57.89 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  49.47 
 
 		 183 aa  96.3  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0109  hypothetical protein  50.62 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  34.48 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0266  hypothetical protein  41.1 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0044  hypothetical protein  29.9 
 
 		 254 aa  62  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0083  hypothetical protein  29.9 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  32.26 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  32.97 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  34.38 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  30 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  30.43 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  30.43 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  26.32 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0347  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  26.53 
 
 		 531 aa  50.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 		 518 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  27.38 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0606  GGDEF family protein  37.5 
 
 		 385 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.369805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  35.37 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  27.17 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.04 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  27.17 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  27.59 
 
 		 615 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  38.89 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  29.17 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  31.4 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  31.4 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1406  hemerythrin  27.78 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.039713  normal  0.0262691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  34.83 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  30.12 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 515 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.76 
 
 		 1328 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.23 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3649  hemerythrin-like, metal-binding  27.5 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  30.49 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  26.09 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  29.21 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  26.26 
 
 		 209 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  29.55 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  32.89 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  29.76 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2834  hemerythrin-like metal-binding protein  29.03 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.84 
 
 		 518 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  30.95 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  30.11 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.86 
 
 		 515 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  35.8 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  23.08 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  32.56 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1523  hemerythrin  23.53 
 
 		 262 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.73 
 
 		 941 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 144 aa  43.9  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  23.08 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  28.12 
 
 		 519 aa  42.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  24.18 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  28.72 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  32.18 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  27.06 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  23.46 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  30.67 
 
 		 722 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  24.21 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  26.88 
 
 		 470 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  22.83 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  22.99 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  27.66 
 
 		 138 aa  42  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.16 
 
 		 530 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  26.74 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  29.79 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  28.74 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  24.39 
 
 		 631 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  29.63 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  23.46 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  23.16 
 
 		 736 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  24.14 
 
 		 132 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  28.09 
 
 		 133 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.11 
 
 		 768 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  28.41 
 
 		 133 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  28.41 
 
 		 133 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  26.03 
 
 		 131 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1871  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  28.87 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  24.72 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  31.11 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.37 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  24.73 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  29.87 
 
 		 277 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  23.08 
 
 		 368 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  24.39 
 
 		 667 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  28.12 
 
 		 498 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>