85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1406 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1406  hemerythrin  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.039713  normal  0.0262691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1670  hypothetical protein  47.37 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  27.27 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  29.75 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  29.75 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  34.38 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.97 
 
 		 997 aa  57  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2268  hemerythrin-related protein  29.52 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.501223  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  30.47 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  27.27 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  27.27 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  31.58 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  24.62 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  30.53 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  34.52 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.33 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  22.9 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  25.83 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  27.27 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.95 
 
 		 941 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1871  hemerythrin-like metal-binding protein  29.13 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  24.03 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  30.08 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  25.76 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  27.5 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  28.36 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  26.83 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  26.81 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  27.27 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  26.45 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  27.56 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1104  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  27.78 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  26.87 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0083  hypothetical protein  24.43 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  33.06 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0044  hypothetical protein  25.2 
 
 		 254 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  29.55 
 
 		 519 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  25.58 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  27.07 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  27.01 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  27.27 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  30 
 
 		 631 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  26.45 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  30.17 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  32.26 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 689 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.03 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  29.46 
 
 		 470 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.27 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.89 
 
 		 963 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  25.78 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.95 
 
 		 559 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  30.93 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  23.08 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  28.03 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  26.67 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  31.15 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  31.15 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  25 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  26.72 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  27.69 
 
 		 176 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 779 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  26.5 
 
 		 667 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  27.97 
 
 		 131 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2683  hemerythrin HHE cation binding region  29.92 
 
 		 127 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231779  hitchhiker  0.00433407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  23.66 
 
 		 1328 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  27.61 
 
 		 134 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0109  hypothetical protein  31.33 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  24.6 
 
 		 529 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  28.81 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.33 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  23.48 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.97 
 
 		 963 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.3 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  26.28 
 
 		 736 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.4 
 
 		 529 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  26.87 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  27.87 
 
 		 131 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.58 
 
 		 529 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>