193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2929 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  270  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  54.96 
 
 
138 aa  157  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  51.91 
 
 
134 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  51.91 
 
 
134 aa  147  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  47.73 
 
 
137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  45.8 
 
 
132 aa  129  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  40.31 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  39.69 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  42.86 
 
 
139 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  40.48 
 
 
155 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  38.93 
 
 
140 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  43.08 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  36.15 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  38.17 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  43.08 
 
 
133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  43.08 
 
 
133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  37.69 
 
 
138 aa  103  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  38.17 
 
 
152 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  37.4 
 
 
152 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  38.28 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  36.43 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  35.88 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  35.88 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  38.17 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.11 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.88 
 
 
133 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  39.02 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  34.35 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  39.53 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  35.11 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 
518 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  36.64 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  34.15 
 
 
135 aa  84.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  37.98 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  37.98 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  34.38 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  32.82 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  37.1 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  32 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  32 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  34.62 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  33.07 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  34.13 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  32.06 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 
722 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  31.2 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  32.82 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 
518 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.06 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  30.71 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  32.06 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 
941 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
515 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  34.65 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  30.53 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 
963 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  32.06 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
515 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  30.23 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  31.01 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  29.46 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  32.56 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 
994 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  30.08 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 
963 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  33.08 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  30.23 
 
 
519 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  32.52 
 
 
667 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 
736 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 
529 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2564  hemerythrin-like metal-binding protein  25.58 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.059586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 
529 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 
518 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 
529 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 
529 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
559 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 
529 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 
529 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  26.56 
 
 
188 aa  62.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 
529 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 
360 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 
526 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  34.92 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  31.78 
 
 
529 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  27.56 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  34.92 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2568  hemerythrin-like metal-binding protein  25.58 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00123244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.16 
 
 
997 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  31.06 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 
689 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0473  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>