171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3698 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3698  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 211 aa  400  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4492  lysine exporter protein LysE/YggA  72.09 
 
 		 222 aa  277  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.885148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2057  lysine exporter protein LysE/YggA  59.2 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.62 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.5 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  39.38 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  37.95 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.41 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  40.89 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.5 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.59 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.33 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  40.49 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  42.93 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  42.57 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.12 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  40.8 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  39.18 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  40.48 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  35.64 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.54 
 
 		 205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.8 
 
 		 201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  44.22 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  39.68 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.71 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.5 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 200 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  41.36 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  41.87 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  42.78 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  38.02 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.61 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  39.3 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  39.59 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  38.66 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  39.29 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3484  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.3 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.3 
 
 		 276 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  38.66 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  38.66 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  38.66 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  38.66 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  38.66 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  38.66 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  38.66 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.52 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  38.86 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  39.79 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  39.79 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2508  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.62 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  39.79 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 203 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 		 206 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  39.62 
 
 		 219 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  37.88 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  37.7 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  37.88 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  37.95 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  34.52 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  41.21 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  38.54 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  37.98 
 
 		 220 aa  104  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  38.2 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  38.86 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03559  hypothetical protein  34.57 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  41 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  36.55 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.26 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4136  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2966  hypothetical protein  32.67 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  32.5 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  40.91 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  37.5 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  40.5 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  32.49 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2816  hypothetical protein  32.18 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  36.41 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  35.45 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  36.55 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77034  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>