184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1384 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  100 
 
 		 100 aa  199  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  49.44 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  45 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  35.11 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  38.04 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  32.58 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  34.83 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  39.76 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  36.9 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  35.87 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  35 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  34.04 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  32.63 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  34.52 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  34.52 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  36.84 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  32.18 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1454  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  32.18 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  32.18 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  35.11 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3210  30S ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  31.76 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  34.83 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  31.63 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  32.58 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  30.61 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0456  30S ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  33.67 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  30.61 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  32.98 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  33.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  31.91 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  32.26 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  32.94 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  34.09 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  34.38 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  33.75 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  31.76 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  34.38 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  32.14 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  32.56 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  30.59 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  36.9 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2726  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000316732  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  36.46 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1080  30S ribosomal protein S20  33.71 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000335633  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  31.76 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  32.97 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2122  30S ribosomal protein S20  32.14 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00639471  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  30.34 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  35.8 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>