More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1083 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  44.63 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  45.74 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  42.03 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.9 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  42.61 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  41.69 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  41.69 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  41.69 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  43.36 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.19 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  41.69 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.14 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  39 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  41.84 
 
 		 316 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  40.92 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  43.54 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  42.96 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  37.85 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  41.9 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  41.9 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  41.9 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  41.86 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  43.31 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.57 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  40.47 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.35 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  40.27 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  42.5 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  30.67 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.97 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  36.75 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.93 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.93 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  33.56 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  32.68 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  33.21 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  31.6 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  31.6 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.55 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  31.95 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.14 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.8 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  32.25 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  30.21 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  29.97 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  31.06 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  31.25 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  45.26 
 
 		 154 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  45.26 
 
 		 154 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  32.4 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.03 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  30.87 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  32.99 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  32.41 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.84 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  32.41 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  32.81 
 
 		 268 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  32.81 
 
 		 268 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  32.81 
 
 		 268 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  34.98 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.99 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  33.45 
 
 		 301 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  28 
 
 		 295 aa  89.4  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  31.45 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  33.47 
 
 		 236 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  32.27 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  26.83 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.72 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  28.38 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  29.62 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  29.69 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  29.17 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  29.57 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  31.37 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.93 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  29.32 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  34.93 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.12 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.08 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  38.24 
 
 		 143 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  25.85 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  38.24 
 
 		 143 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.99 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  30.59 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  26.97 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  30.2 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  29.73 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>