More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0541 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  42.6 
 
 		 851 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  75.61 
 
 		 817 aa  1278    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  43.34 
 
 		 847 aa  639    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  72.9 
 
 		 819 aa  1207    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  47.04 
 
 		 830 aa  699    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.76 
 
 		 817 aa  764    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0466  penicillin-binding protein  43.52 
 
 		 863 aa  644    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  44.6 
 
 		 822 aa  663    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  45.22 
 
 		 839 aa  676    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  75.25 
 
 		 814 aa  1273    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  46.06 
 
 		 794 aa  738    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  46.57 
 
 		 794 aa  739    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  74.88 
 
 		 814 aa  1269    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1884  penicillin-binding protein 1A  43.97 
 
 		 868 aa  652    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  43.89 
 
 		 844 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  44.25 
 
 		 844 aa  668    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  46.02 
 
 		 793 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  48.18 
 
 		 793 aa  756    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  50 
 
 		 814 aa  769    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  75.03 
 
 		 815 aa  1261    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 803 aa  1640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  50.86 
 
 		 803 aa  706    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  42.68 
 
 		 843 aa  651    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  46.69 
 
 		 804 aa  698    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  42.6 
 
 		 851 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  44.23 
 
 		 777 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0157  penicillin-binding protein, 1A family protein  41.76 
 
 		 851 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  45.13 
 
 		 839 aa  666    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  45.34 
 
 		 807 aa  644    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  44.25 
 
 		 844 aa  667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  75.61 
 
 		 817 aa  1273    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  49.11 
 
 		 846 aa  817    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  48.18 
 
 		 793 aa  756    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  43.18 
 
 		 791 aa  648    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  44.5 
 
 		 790 aa  662    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  43.41 
 
 		 865 aa  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  45.11 
 
 		 839 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002321  multimodular transpeptidase-transglycosylase  42.77 
 
 		 825 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000241558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  71.58 
 
 		 823 aa  1233    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  75 
 
 		 817 aa  1277    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  43.22 
 
 		 849 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  42.6 
 
 		 851 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  75.61 
 
 		 817 aa  1278    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  42.95 
 
 		 835 aa  638    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  43.19 
 
 		 846 aa  646    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  44.73 
 
 		 839 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  44.81 
 
 		 839 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  49.34 
 
 		 800 aa  729    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  44.73 
 
 		 839 aa  671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  48.93 
 
 		 814 aa  788    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  50 
 
 		 846 aa  775    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  71.34 
 
 		 823 aa  1229    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  42.42 
 
 		 851 aa  633  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  41.64 
 
 		 850 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  41.76 
 
 		 850 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  41.64 
 
 		 850 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  41.64 
 
 		 850 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  41.52 
 
 		 850 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0207  1A family penicillin-binding protein  41.17 
 
 		 861 aa  626  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0421791 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  41.07 
 
 		 850 aa  625  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0369  penicillin-binding protein, 1A family protein  40.8 
 
 		 885 aa  624  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0358767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  42.22 
 
 		 851 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  40.46 
 
 		 855 aa  622  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  40.64 
 
 		 832 aa  621  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  42.47 
 
 		 852 aa  621  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1790  1A family penicillin-binding protein  44.3 
 
 		 809 aa  617  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  40.17 
 
 		 850 aa  617  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  40.17 
 
 		 850 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  40.17 
 
 		 850 aa  616  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  41.44 
 
 		 852 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  40.05 
 
 		 850 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  40.05 
 
 		 850 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  39.91 
 
 		 858 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1861  peptidoglycan glycosyltransferase  44.04 
 
 		 854 aa  615  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.894237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  40.05 
 
 		 850 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  40.05 
 
 		 850 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  43.68 
 
 		 796 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  44.3 
 
 		 837 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  41.54 
 
 		 851 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  43.1 
 
 		 797 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  44.47 
 
 		 852 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  43.1 
 
 		 797 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  44.34 
 
 		 846 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  44.34 
 
 		 840 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  44.34 
 
 		 840 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  44.47 
 
 		 840 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  43.62 
 
 		 839 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  43.24 
 
 		 797 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  43.1 
 
 		 797 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  43.62 
 
 		 839 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  44.34 
 
 		 840 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  43.62 
 
 		 839 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  44.47 
 
 		 840 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  43.6 
 
 		 838 aa  601  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  44.47 
 
 		 840 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  43.76 
 
 		 839 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02356  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  42.4 
 
 		 809 aa  599  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.448545  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  41.76 
 
 		 795 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  41.76 
 
 		 797 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  44.03 
 
 		 839 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>