More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2802 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 377 aa  791    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  65.68 
 
 		 371 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  64.32 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  53.97 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  48.53 
 
 		 372 aa  362  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  46.74 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  38.13 
 
 		 377 aa  269  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  32.57 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 407 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  30.02 
 
 		 430 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 399 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 		 459 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 459 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 459 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 459 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  34.27 
 
 		 369 aa  92.8  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 459 aa  90.1  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.95 
 
 		 459 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 		 459 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.97 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.97 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  31.01 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.74 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.19 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  32.64 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  24.69 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  31.88 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.56 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  37.27 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  30.29 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  33.54 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  33.54 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  33.54 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  23.31 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  31.62 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  26.44 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  26.36 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.63 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  32.23 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  36.46 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  35.38 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  26.56 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  34.04 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 667 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>