More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2946 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  865    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  52.17 
 
 		 439 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  51.49 
 
 		 439 aa  441  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  51.95 
 
 		 439 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  55.43 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1922  homoserine dehydrogenase  54.67 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  53.35 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  53.76 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  53.53 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  52.89 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  51.73 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  50.11 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  51.49 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  49.43 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  54.15 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  53.33 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  52.42 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  48.74 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  51.61 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  50.93 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  52.17 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  50.91 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  50.69 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  50.69 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  51.83 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2495  homoserine dehydrogenase  51.61 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.35731  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  51.94 
 
 		 441 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  50.46 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  51.6 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  50.34 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  50 
 
 		 440 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2698  homoserine dehydrogenase  51.14 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  48.06 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  49.89 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  50.11 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  49.32 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  49.55 
 
 		 439 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  49.65 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  45.79 
 
 		 438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  47.05 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  45.8 
 
 		 436 aa  352  8e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  44.77 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  45.91 
 
 		 440 aa  347  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  45.21 
 
 		 433 aa  346  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  46.6 
 
 		 438 aa  342  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  43.51 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  44.79 
 
 		 440 aa  339  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  42.6 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  42.46 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  47.1 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  44.62 
 
 		 444 aa  335  7e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 438 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  44.81 
 
 		 449 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  43.48 
 
 		 463 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  45.52 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  45.76 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  43.89 
 
 		 440 aa  333  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  43.51 
 
 		 438 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  44.65 
 
 		 442 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  44.65 
 
 		 442 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  44.65 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  41.74 
 
 		 427 aa  330  2e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  45.52 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  43.61 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  43.61 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  45.12 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  43.96 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  49.51 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  43.53 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  42.01 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  45.77 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  44.37 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0810  homoserine dehydrogenase  50 
 
 		 444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0112934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 434 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  43.48 
 
 		 434 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 		 423 aa  325  9e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  43.96 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  44.79 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  45.08 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  43.74 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  43.45 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  42.33 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  45.79 
 
 		 453 aa  322  6e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 		 453 aa  322  6e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  45.32 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3015  homoserine dehydrogenase  48.07 
 
 		 429 aa  320  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  44.31 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>