More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0312 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  79.61 
 
 
457 aa  727    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
457 aa  925    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  74.4 
 
 
458 aa  726    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.83 
 
 
475 aa  380  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.09 
 
 
481 aa  336  5e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.68 
 
 
454 aa  300  5e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.19 
 
 
458 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.51 
 
 
459 aa  229  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.79 
 
 
488 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.94 
 
 
477 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.61 
 
 
473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26 
 
 
474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.97 
 
 
478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  28.34 
 
 
542 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.78 
 
 
458 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.88 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.71 
 
 
552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.66 
 
 
504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.38 
 
 
479 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.73 
 
 
437 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.86 
 
 
529 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.29 
 
 
479 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.29 
 
 
479 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.32 
 
 
464 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.67 
 
 
458 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 
456 aa  157  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.97 
 
 
469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.8 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.46 
 
 
505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.03 
 
 
523 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.74 
 
 
528 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.45 
 
 
503 aa  153  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.14 
 
 
546 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 
544 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.54 
 
 
547 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  29.3 
 
 
513 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.16 
 
 
459 aa  145  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.62 
 
 
463 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.7 
 
 
478 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.21 
 
 
483 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  28.51 
 
 
477 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.19 
 
 
484 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.98 
 
 
483 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  28.51 
 
 
477 aa  143  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.39 
 
 
543 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  28.54 
 
 
499 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.97 
 
 
491 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.55 
 
 
522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 
504 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.41 
 
 
480 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.69 
 
 
503 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.18 
 
 
489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.58 
 
 
454 aa  140  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.86 
 
 
460 aa  140  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.92 
 
 
475 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  29.84 
 
 
481 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  34.17 
 
 
477 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.2 
 
 
476 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  34.17 
 
 
477 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  34.17 
 
 
477 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  28.13 
 
 
475 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  34.17 
 
 
477 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  34.17 
 
 
477 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.23 
 
 
504 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  34.17 
 
 
477 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.53 
 
 
480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  34.17 
 
 
477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.27 
 
 
477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.1 
 
 
480 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.79 
 
 
478 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.15 
 
 
498 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.83 
 
 
481 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  32.83 
 
 
481 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.38 
 
 
443 aa  136  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  28.51 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.17 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1293  TldD/PmbA family protein  26.58 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00519979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  29.56 
 
 
512 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.06 
 
 
517 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.23 
 
 
480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  27.88 
 
 
505 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0100  microcin-processing peptidase 2  32.81 
 
 
477 aa  133  6e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.884188  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.41 
 
 
480 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0152  tldD protein  32.17 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  26.8 
 
 
480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.87 
 
 
486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  34.52 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  29.56 
 
 
430 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.87 
 
 
486 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  33.98 
 
 
481 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  27.96 
 
 
484 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  27.65 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.87 
 
 
505 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.53 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  27.47 
 
 
480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.87 
 
 
505 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.9 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.87 
 
 
505 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>