More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3721 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  100 
 
 
195 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  54.59 
 
 
206 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  55.61 
 
 
190 aa  202  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  51.06 
 
 
199 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  52.11 
 
 
193 aa  188  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  48.7 
 
 
197 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  46.99 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  46.45 
 
 
202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  45.41 
 
 
204 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  45.95 
 
 
204 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  46.77 
 
 
201 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  46.99 
 
 
199 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  43.48 
 
 
196 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  46.7 
 
 
199 aa  168  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  44.26 
 
 
203 aa  166  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  46.81 
 
 
204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  45.95 
 
 
204 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  41.94 
 
 
197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  46.28 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  47.25 
 
 
194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  50.93 
 
 
191 aa  160  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  45.6 
 
 
191 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  46.67 
 
 
203 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  45.98 
 
 
196 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  44.26 
 
 
192 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  43.24 
 
 
203 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  45.9 
 
 
191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  45.36 
 
 
191 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  43.1 
 
 
211 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  45.36 
 
 
191 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  43.09 
 
 
193 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  45.11 
 
 
189 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  43.32 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  44.25 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  39.79 
 
 
212 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  41.95 
 
 
193 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  41.62 
 
 
194 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  41.21 
 
 
337 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  39.78 
 
 
327 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  38.59 
 
 
205 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  38.71 
 
 
351 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  40.96 
 
 
191 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.76 
 
 
341 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.76 
 
 
341 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  39.34 
 
 
338 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.76 
 
 
340 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  38.59 
 
 
334 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2383  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.23 
 
 
369 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  39.67 
 
 
354 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  36.26 
 
 
345 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.08 
 
 
369 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0614  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.66 
 
 
341 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00621124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  36.96 
 
 
340 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  38.54 
 
 
365 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  37.57 
 
 
347 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16480  chemotaxis-specific methylesterase  38.62 
 
 
335 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00306037  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.41 
 
 
350 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1435  chemotaxis-specific methylesterase  39.23 
 
 
335 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  36.22 
 
 
350 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.56 
 
 
365 aa  117  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  36.26 
 
 
344 aa  117  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.12 
 
 
347 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  39.13 
 
 
341 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0417  putative protein-glutamate methylesterase  36.17 
 
 
375 aa  115  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  35.87 
 
 
340 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.97 
 
 
357 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.2 
 
 
339 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  36.26 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1322  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.64 
 
 
424 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3433  chemotaxis-specific methylesterase  34.57 
 
 
386 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.891132  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.59 
 
 
371 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  39.04 
 
 
349 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  33.87 
 
 
370 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0765  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.08 
 
 
367 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  33.87 
 
 
370 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.08 
 
 
367 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6788  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.22 
 
 
343 aa  111  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1983  protein-glutamate methylesterase CheB  34.04 
 
 
390 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  33.87 
 
 
374 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  36 
 
 
344 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  33.87 
 
 
376 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.96 
 
 
371 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2801  chemotaxis-specific methylesterase  34.41 
 
 
375 aa  111  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1567  chemotaxis-specific methylesterase  33.33 
 
 
378 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  34.92 
 
 
362 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  36 
 
 
344 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0248  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.1 
 
 
358 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.185703  normal  0.030578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  38.25 
 
 
349 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.48 
 
 
1453 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.33 
 
 
1138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1971  chemotaxis-specific methylesterase  35.42 
 
 
381 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.31 
 
 
367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.12 
 
 
355 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.33 
 
 
355 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1037  CheB methylesterase  33.7 
 
 
189 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.48 
 
 
365 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.09 
 
 
419 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.91 
 
 
376 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  33.33 
 
 
387 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2403  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.97 
 
 
361 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>