More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3907 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
379 aa  780    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  44.03 
 
 
376 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
396 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  31.89 
 
 
393 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
390 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
389 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
389 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
395 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  28.4 
 
 
390 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25.13 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
377 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.51 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  23.92 
 
 
415 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.44 
 
 
383 aa  102  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
402 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
384 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
388 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
378 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
378 aa  90.9  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  21.79 
 
 
417 aa  89.7  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  26.35 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3025  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
389 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
369 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  23.35 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13881  hypothetical protein  26.41 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.812309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.06 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
365 aa  69.3  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  24.22 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  25.88 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.76 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
419 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  26.29 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  21.76 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
427 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0384  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
392 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
477 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
435 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3683  glycosyl transferase, group 1  22.37 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1830  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  21.49 
 
 
346 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.17 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.17 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 
348 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  21.83 
 
 
355 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
398 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  21.18 
 
 
372 aa  63.2  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  20.92 
 
 
382 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  20.59 
 
 
360 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  24.34 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  22.72 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4060  glycosyl transferase group 1  21.29 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.586915  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  24.14 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.08 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0922  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
395 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
391 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  23.76 
 
 
382 aa  59.7  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  24 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
373 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.76 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>