More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2972 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  100 
 
 		 234 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  39.39 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  37.66 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  41.53 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  37.93 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  35.63 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  39.59 
 
 		 255 aa  158  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  36.48 
 
 		 240 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  36.05 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  33.91 
 
 		 239 aa  148  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  35.98 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  35.98 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  36.32 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  37.61 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  36.32 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  33.21 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  34.51 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  34.75 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  33.33 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  34.62 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  35.1 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  37.97 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  32.77 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  36.55 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  32.77 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  32.35 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  32.35 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  33.47 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  33.33 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  35.04 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  30.65 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  32.91 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  32.91 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  32.91 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  31.97 
 
 		 265 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  33.19 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  33.19 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.19 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  33.19 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  33.19 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  33.19 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  33.19 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  32.1 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  33.61 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  33.19 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  32.91 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  33.33 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  33.47 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  34.75 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  33.04 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  28.7 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  28.49 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  27.88 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  28.11 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  28.64 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  27.43 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.12 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  29.38 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  32.77 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  28.57 
 
 		 414 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  25.45 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  24.34 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 354 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  32.87 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  31.13 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  34.88 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.77 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  42.86 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.16 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  32.81 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  25.26 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  32.77 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  26.7 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  33.06 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  31.17 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  32.84 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  24.54 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  40.22 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0822  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.47 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  25 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  30 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.95 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  47.44 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  27.78 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  28.49 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  25.32 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.61 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2252  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.74 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2223  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.74 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.71 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  25.6 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  31.82 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  32.03 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.36 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.74 
 
 		 394 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.18 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>