More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2657 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2657  response regulator receiver  100 
 
 		 121 aa  243  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  0.494085 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 239 aa  105  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.17 
 
 		 231 aa  100  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 374 aa  97.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0174  response regulator receiver  41.53 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 369 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 224 aa  94  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 235 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 236 aa  94  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 231 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 227 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 231 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 231 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 225 aa  90.5  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 232 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  35.83 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 234 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1134  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461969  hitchhiker  0.00297359 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.46 
 
 		 226 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 231 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 242 aa  88.6  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 228 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 261 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 228 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 381 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 225 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  37.5 
 
 		 235 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  37.5 
 
 		 235 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  37.5 
 
 		 235 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  37.5 
 
 		 235 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  37.5 
 
 		 235 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  37.5 
 
 		 235 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  37.5 
 
 		 235 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1223  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1155  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1095  response regulator receiver domain-containing protein  37.72 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 227 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 238 aa  87  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 236 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  36.67 
 
 		 225 aa  87  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 231 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  34.71 
 
 		 233 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  37.5 
 
 		 227 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 233 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 241 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.19 
 
 		 236 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4244  response regulator receiver  33.88 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.231952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  34.71 
 
 		 233 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.04 
 
 		 238 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.66 
 
 		 317 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  36.67 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 230 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  36.67 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 238 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 238 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 230 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 237 aa  84.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.62 
 
 		 239 aa  84.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 236 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.48 
 
 		 223 aa  84.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 235 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 		 403 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 393 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05331  transcriptional regulatory protein CpxR  39.66 
 
 		 280 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 272 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 390 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 239 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 233 aa  84  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 234 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  38.14 
 
 		 234 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  36.45 
 
 		 228 aa  84  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.656178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3508  response regulator receiver  38.66 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.59 
 
 		 469 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 454 aa  84  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 228 aa  84  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.83 
 
 		 310 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 223 aa  83.6  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2332  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.25 
 
 		 227 aa  83.6  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0100882  decreased coverage  0.00000063533 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 277 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 228 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 229 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4712  two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 228 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541483  normal  0.0134498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 234 aa  83.6  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 231 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1412  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 225 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.0125199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>