More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1190 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  100 
 
 		 225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  59.55 
 
 		 228 aa  257  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  54.5 
 
 		 236 aa  237  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  53.6 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  52.05 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  51.33 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  47.83 
 
 		 232 aa  214  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  45 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.27 
 
 		 517 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  41.4 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  48.28 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  40.44 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.44 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  47.12 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  46.04 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  39.37 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  40.64 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  40.62 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.36 
 
 		 516 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  44.3 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 227 aa  167  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.78 
 
 		 534 aa  167  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.87 
 
 		 516 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  40.36 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.76 
 
 		 511 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  42.15 
 
 		 238 aa  165  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.76 
 
 		 511 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  43.96 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  38.76 
 
 		 539 aa  163  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.38 
 
 		 488 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.56 
 
 		 528 aa  162  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  39.17 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.61 
 
 		 529 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  39.02 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  44.06 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.41 
 
 		 480 aa  158  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  39.02 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  40.89 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  39.63 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.5 
 
 		 526 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  37.99 
 
 		 514 aa  156  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  39.15 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  42.51 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  40 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  40 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  40 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  36.65 
 
 		 230 aa  154  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 229 aa  154  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  38.74 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  37.1 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  37.1 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  37.1 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  38.21 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  38.68 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  38.21 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  38.21 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.41 
 
 		 483 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>