More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1002 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 499 aa  999    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  77.92 
 
 		 469 aa  748    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  60.17 
 
 		 473 aa  555  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  58.66 
 
 		 472 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  58.79 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  48.71 
 
 		 490 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  47.85 
 
 		 522 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  34.8 
 
 		 489 aa  270  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  33.9 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  31.95 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  35.1 
 
 		 439 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  31.98 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  32.38 
 
 		 495 aa  216  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  33.19 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  31.72 
 
 		 452 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  30.57 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  30.37 
 
 		 440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  30.23 
 
 		 438 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  30.23 
 
 		 438 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  30.23 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  30.02 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  30.23 
 
 		 438 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  30.23 
 
 		 438 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  30.23 
 
 		 438 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  30.23 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  32.03 
 
 		 452 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  28.9 
 
 		 435 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  25.05 
 
 		 458 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.56 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  23.52 
 
 		 444 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  30.29 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  26.04 
 
 		 580 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.39 
 
 		 480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  24.9 
 
 		 609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  26.23 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 		 442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.44 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.44 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.59 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.59 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 382 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.76 
 
 		 471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.35 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.76 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 452 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.49 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.49 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.49 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  25.66 
 
 		 460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.44 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.73 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  25.27 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.73 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  22.52 
 
 		 494 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  25.05 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 495 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 471 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  24.73 
 
 		 471 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.73 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.52 
 
 		 467 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.26 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.52 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.02 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.15 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.1 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.47 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  25.68 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  26.67 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 541 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  26.22 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  26.22 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 541 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23.23 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>