More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4751 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 447 aa  918    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  58.39 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  46.41 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  46.95 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  43.67 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  44.7 
 
 		 448 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 		 448 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 443 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  35.45 
 
 		 439 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  37.83 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  31.76 
 
 		 438 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  34.38 
 
 		 442 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 430 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 446 aa  186  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  29.23 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  28.18 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 480 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 459 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  27.93 
 
 		 428 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 428 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  25.12 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  27.82 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2579  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612583  normal  0.495768 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  26.68 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 428 aa  117  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  30.64 
 
 		 431 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  28.39 
 
 		 437 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.63 
 
 		 426 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.38 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  27.38 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.38 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  26.67 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  27.38 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  27.95 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.38 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  26.07 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  26.73 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  27.74 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 478 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  25.79 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 431 aa  113  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  26.44 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 494 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 423 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 433 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 443 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>