More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4401 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  72.39 
 
 		 330 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  71.04 
 
 		 330 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  69.6 
 
 		 330 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  51.75 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  49.83 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.68 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  48.49 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  45.77 
 
 		 322 aa  300  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.99 
 
 		 331 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.95 
 
 		 335 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.13 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.13 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  48.34 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  49.15 
 
 		 349 aa  288  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.23 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  46.15 
 
 		 327 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  46.43 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.11 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  49.83 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  48.16 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.18 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.18 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  48.84 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  47.23 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  45.87 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  46.38 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.69 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  45.48 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  49.5 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.55 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.57 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  43.64 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  46.15 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.2 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  46.18 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.06 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4453  hypothetical protein  49.16 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.81 
 
 		 330 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  45.37 
 
 		 341 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.54 
 
 		 328 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.43 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  46.67 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  47.7 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.32 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.21 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  46.95 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.62 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.52 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  46.67 
 
 		 337 aa  272  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.78 
 
 		 339 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.93 
 
 		 336 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.88 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  46.53 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.44 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  46.13 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.67 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.15 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  45.12 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  45.82 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  43.81 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  45.28 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.97 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.97 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  44.85 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  44.37 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.03 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6352  hypothetical protein  44.55 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.997284  normal  0.0840681 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  45.51 
 
 		 332 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  45.39 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.44 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4449  extra-cytoplasmic solute receptor  45.96 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  0.159319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.11 
 
 		 324 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  46.2 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  42.07 
 
 		 343 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  46.73 
 
 		 358 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  44.85 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.32 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.46 
 
 		 323 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  43.48 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  49.17 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  45.4 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  45.89 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.56 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  44.55 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.95 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.73 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.77 
 
 		 325 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  45.81 
 
 		 356 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.5 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.55 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  43.1 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  46.28 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.68 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  44.31 
 
 		 329 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  45.03 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  45.42 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  46.75 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  43.33 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>