More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1848 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  100 
 
 		 200 aa  401  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1515  YceI family protein  50.25 
 
 		 202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.601487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  49.12 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  47.95 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  31.96 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  31.33 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.61 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  32.92 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  28.28 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  29.88 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  32.42 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  29 
 
 		 189 aa  89  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  30.53 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  25.15 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  29.94 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  29.53 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  24.75 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  29.53 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  32.03 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  28.14 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  30.64 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  27.66 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  31.93 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  31.93 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  31.93 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  31.93 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  31.93 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  31.93 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  31.93 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  31.93 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  38.05 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  32.47 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  31.03 
 
 		 175 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  30.46 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  30.46 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  30.46 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  26.9 
 
 		 182 aa  84.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  31.33 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  37.17 
 
 		 191 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  31.4 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  31.13 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  29.89 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  29.89 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  29.89 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  29.89 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  30.46 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  24.73 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  30.64 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  31.13 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  30.64 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  29.89 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  28.08 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  28.28 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  30.43 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  29.8 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  30.46 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  30.46 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  30.46 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  30.46 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  28.74 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  32.48 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  28.48 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  30.91 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  32.24 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  29.68 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  26.04 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  31.51 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  29.73 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  30.87 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  28.16 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  29.61 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  35.94 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  34.72 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  27.16 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  26.54 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  29.94 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  27.16 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  34.03 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  31.9 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  27.96 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  28.99 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  34.03 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  29.31 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  28.86 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  33.62 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  30.34 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  29.17 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  28.04 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  26.71 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  32.48 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  32.48 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  29.81 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  27.27 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  31.29 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  28.57 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  28.97 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>