109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0973 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  60.77 
 
 
218 aa  263  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  60.27 
 
 
221 aa  252  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  55.61 
 
 
208 aa  228  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.87 
 
 
214 aa  225  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  58.13 
 
 
202 aa  224  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  54.63 
 
 
206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003796  putative cytochrome oxidase  57.92 
 
 
203 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  58.05 
 
 
206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  58.05 
 
 
206 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  58.05 
 
 
206 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  58.05 
 
 
206 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  58.05 
 
 
206 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  58.05 
 
 
206 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.4 
 
 
205 aa  210  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  57.07 
 
 
206 aa  208  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  58.42 
 
 
206 aa  208  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.84 
 
 
205 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.25 
 
 
201 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.75 
 
 
206 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.3 
 
 
202 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.86 
 
 
215 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0215894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.09 
 
 
186 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.73 
 
 
205 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.3 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.65 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.56 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  44.16 
 
 
202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.23 
 
 
157 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.28 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.46 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.33 
 
 
215 aa  84.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.33 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  27.81 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  27.27 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  43.68 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  41.86 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.7 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.83 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.15 
 
 
195 aa  55.1  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.63 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.54 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.46 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.82 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.58 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.58 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.75 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.75 
 
 
201 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  35.29 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 
230 aa  48.9  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0295  CDP-alcohol phosphatidyl transferase  29.41 
 
 
259 aa  48.5  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  25 
 
 
195 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
205 aa  48.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.18 
 
 
192 aa  48.5  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.04 
 
 
193 aa  48.1  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.85 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.83 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.25 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0780  putative CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  30 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.33 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.49 
 
 
315 aa  45.4  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  31.06 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.53 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.79 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3064  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.5 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097831  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.54 
 
 
205 aa  45.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  32.41 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.17 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.24 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.14 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.94 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1115  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.14 
 
 
304 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.94 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.94 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.02 
 
 
499 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.94 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00437888  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.64 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.78 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.67 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.64 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.12 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.92 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.98 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  32.69 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.11 
 
 
428 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2686  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.57 
 
 
292 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0505612  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
245 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
245 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.293518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.97 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.47 
 
 
233 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.5 
 
 
194 aa  42.4  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.44 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  36.47 
 
 
233 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 
201 aa  42.4  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1046  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
177 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.11 
 
 
410 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2439  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
246 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247509 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.29 
 
 
226 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>