55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2531 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 205 aa  390  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.77 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  45.73 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  47.74 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  49.25 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.74 
 
 		 221 aa  175  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.73 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003796  putative cytochrome oxidase  46.31 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.72 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.51 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.94 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.5 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.28 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.25 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.52 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.52 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.52 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  51.52 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  51.52 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  52.02 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.52 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.52 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50 
 
 		 186 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.5 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.26 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.76 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.29 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  47.29 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.32 
 
 		 157 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.44 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.89 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.67 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.87 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.8 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  26.74 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  26.74 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.9 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  38.2 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.52 
 
 		 410 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.2 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.05 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.16 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.66 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0818  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  58.33 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.259617  normal  0.0304131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  27.43 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.66 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.95 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.67 
 
 		 199 aa  42  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.13 
 
 		 212 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.48 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 		 428 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>