47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1272 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  76.12 
 
 		 202 aa  323  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  68.29 
 
 		 208 aa  301  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003796  putative cytochrome oxidase  73.13 
 
 		 203 aa  298  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  64.88 
 
 		 205 aa  279  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.5 
 
 		 201 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  60 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  60.49 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  60.49 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  60.49 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  60.49 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  60.49 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  60.49 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  61.17 
 
 		 206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  59.51 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.63 
 
 		 219 aa  218  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55 
 
 		 206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.88 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.74 
 
 		 221 aa  187  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.57 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.63 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.46 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.51 
 
 		 186 aa  154  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.49 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.36 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.25 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.79 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  45.88 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.65 
 
 		 157 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.59 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.68 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.39 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.69 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  27.06 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  27.61 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.18 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.74 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.84 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.81 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.46 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.04 
 
 		 259 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.54 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  36.59 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.85 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  39.44 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>