50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0390 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 206 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  57.77 
 
 		 208 aa  238  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  58 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.67 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.5 
 
 		 201 aa  225  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003796  putative cytochrome oxidase  60 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  55 
 
 		 206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.46 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.46 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.46 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  51.46 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  51.46 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.94 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  50.97 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.94 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.75 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.97 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.38 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.14 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.14 
 
 		 218 aa  173  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.47 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.78 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.93 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.6 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.85 
 
 		 202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.09 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.35 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  44.85 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.18 
 
 		 157 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.95 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.95 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.82 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.29 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  29.23 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  29.23 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  29.29 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.79 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  41.67 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  41.67 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.86 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.64 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.59 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.49 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  27.69 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  26.34 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  27.23 
 
 		 287 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.67 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  27.53 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  34.29 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.79 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>