93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3334 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 195 aa  370  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.24 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  45.7 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  36.87 
 
 		 198 aa  95.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  36.31 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.96 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.51 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.44 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.96 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.96 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.41 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.41 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.17 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.41 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  30.41 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  30.41 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.41 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.15 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.43 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.64 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.93 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.18 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.44 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.92 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  35.96 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.64 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  29.9 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  27.67 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.94 
 
 		 301 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.67 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  29.6 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.47 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.08 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.82 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.29 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.25 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.75 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.38 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.85 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  36.54 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.83 
 
 		 315 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.54 
 
 		 265 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0227  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.5 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000023759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.68 
 
 		 530 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.7 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  32 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.28 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.9 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.95 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.69 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.72 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.13 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  27.14 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14950  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.19 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28132  phosphatidylinositol synthase  41.07 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.22 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.33 
 
 		 299 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.46 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.12 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.1 
 
 		 163 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.04 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0909  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000543789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  30.46 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.88 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.84 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.32 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.54 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  29.38 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  29.38 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.38 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1236  hypothetical protein  27.59 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0976506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.63 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.72 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.73 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.04 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.75 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 299 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 299 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.64 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.94 
 
 		 211 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.87 
 
 		 205 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.05 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.17 
 
 		 259 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.52 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  35.42 
 
 		 177 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.12 
 
 		 203 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.67 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.35 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>