60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0550 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 252 aa  521  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  87.3 
 
 		 252 aa  461  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  55.31 
 
 		 304 aa  311  5.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  35.61 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  34.15 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  35.12 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  34.55 
 
 		 205 aa  99  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  35.12 
 
 		 207 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  34.54 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  35.2 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  34.93 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  34.03 
 
 		 220 aa  95.9  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  30.5 
 
 		 207 aa  95.1  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  32.04 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  32.04 
 
 		 212 aa  95.1  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  32.49 
 
 		 219 aa  95.1  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  37.23 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  34.41 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.82 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  39.01 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37.96 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  34.62 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  33.86 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  31.94 
 
 		 207 aa  86.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  33.5 
 
 		 232 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  39.85 
 
 		 215 aa  85.9  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  28.8 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  31.84 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  36.96 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  29.95 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  29.84 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  37.96 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  36.49 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.65 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  33.57 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.65 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.65 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.65 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.11 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  37.14 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  29.53 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  28.84 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  32.72 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.19 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.81 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  35.77 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.81 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  29.59 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  33.82 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  29.49 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  29.63 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  34 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  32.97 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  40.85 
 
 		 126 aa  48.9  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  27.68 
 
 		 541 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  30.19 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  29.76 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3466  2OG-Fe(II) oxygenase  28 
 
 		 306 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.413684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>