More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2110 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
268 aa  520  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.24 
 
 
271 aa  385  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0268445 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.94 
 
 
273 aa  224  8e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00426384 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 
276 aa  223  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
283 aa  218  7.999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
274 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
273 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 
281 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  28.41 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  28.41 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 
274 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
293 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0501667  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
269 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
287 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
282 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
290 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  28.9 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  28.9 
 
 
285 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01770  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.66 
 
 
315 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.474975  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
292 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  28.9 
 
 
285 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  28.9 
 
 
285 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  28.9 
 
 
285 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  28.9 
 
 
285 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  28.9 
 
 
285 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
285 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  0.12069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3449  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.46 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000612368  normal  0.971019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
295 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
285 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
285 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
285 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4073  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.9 
 
 
285 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22339  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0867  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.53 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.329849 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  28.52 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
282 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
283 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
283 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  28.29 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7937  ABC transporter (permease)  28.12 
 
 
305 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.78 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 
294 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00536554  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
283 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
283 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
312 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.911681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.27 
 
 
294 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5739  ABC transporter membrane spanning protein  29.39 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  28.74 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1958  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  27.41 
 
 
281 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126876  normal  0.322373 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
270 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744968  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.91 
 
 
293 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
289 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
294 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.72 
 
 
276 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
294 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0152693  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
283 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.23 
 
 
302 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.8 
 
 
293 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.464389  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
300 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.15 
 
 
299 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
283 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
305 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1623  ABC-type sugar transport system permease component-like protein  29.77 
 
 
291 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
305 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
306 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
297 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0531179  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
281 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.43 
 
 
283 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8234  maltose transport protein  28.95 
 
 
271 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367769  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
275 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
288 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
281 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
277 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
285 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
281 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2081  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.74 
 
 
305 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.86 
 
 
306 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.530616  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
290 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
315 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>