More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2340 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
271 aa  526  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0268445 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.24 
 
 
268 aa  402  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.69 
 
 
283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00426384 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
276 aa  211  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
295 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
269 aa  125  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
277 aa  123  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
280 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01770  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.25 
 
 
315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.474975  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7937  ABC transporter (permease)  30.74 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
295 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
281 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
285 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  0.12069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.911681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3449  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.71 
 
 
285 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000612368  normal  0.971019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
285 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  29.13 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  29.13 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  29.13 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  29.13 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  29.13 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  29.13 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  29.13 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  29.13 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4073  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.59 
 
 
285 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22339  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
285 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
287 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
315 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
305 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
282 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
305 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255354  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
305 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  27.45 
 
 
293 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  27.45 
 
 
293 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
293 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0501667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  28.63 
 
 
291 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
293 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.45 
 
 
314 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
320 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  29.18 
 
 
283 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
313 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1058  MalG-type ABC sugar transport system permease component  26.77 
 
 
277 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
273 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0867  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.53 
 
 
293 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.329849 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
283 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8234  maltose transport protein  28.25 
 
 
271 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367769  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2402  ABC transporter membrane spanning protein  26.27 
 
 
317 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
282 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
314 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.95 
 
 
292 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
294 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
281 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
270 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744968  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
285 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
290 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
299 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.45 
 
 
282 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.89 
 
 
302 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
278 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.194848 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
297 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0531179  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
283 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
311 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
294 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.94 
 
 
297 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
306 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.27 
 
 
294 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
307 aa  99.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.402719  normal  0.159625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.45 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.09 
 
 
283 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  27 
 
 
281 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  27 
 
 
281 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 
283 aa  99.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1623  ABC-type sugar transport system permease component-like protein  33.53 
 
 
291 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2081  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.18 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0751871  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9198  ABC transporter  28.47 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1958  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  29.93 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126876  normal  0.322373 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.35 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.547781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.54 
 
 
306 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.530616  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5739  ABC transporter membrane spanning protein  31.1 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
283 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.72 
 
 
292 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>