More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0810 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
295 aa  570  1e-161  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.53 
 
 
283 aa  278  7e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
273 aa  219  6e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00426384 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
276 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
268 aa  152  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
290 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
271 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0268445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
285 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
285 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
285 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
285 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4073  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.56 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22339  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
281 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.911681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  0.12069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3449  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.06 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000612368  normal  0.971019 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
269 aa  125  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  28.82 
 
 
285 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
277 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  28.84 
 
 
281 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  28.84 
 
 
285 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  28.84 
 
 
285 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  28.84 
 
 
285 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  28.84 
 
 
285 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  28.84 
 
 
285 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  28.84 
 
 
285 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9198  ABC transporter  30.41 
 
 
292 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
285 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00536554  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
273 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
294 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
287 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.23 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.828471  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 
314 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.59 
 
 
305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
305 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255354  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
305 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
273 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  29.89 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.23 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
306 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2402  ABC transporter membrane spanning protein  27.99 
 
 
317 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2081  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  27.44 
 
 
305 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 
302 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319412  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0486295  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
296 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
280 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
270 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744968  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0531179  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7937  ABC transporter (permease)  29.27 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.69 
 
 
271 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
302 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0751871  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
292 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
292 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.25 
 
 
297 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.55 
 
 
281 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1958  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  28.07 
 
 
281 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126876  normal  0.322373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
295 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.72 
 
 
300 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.28 
 
 
283 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0067  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.53 
 
 
295 aa  105  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26630  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.57 
 
 
298 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
282 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.7 
 
 
282 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.8 
 
 
314 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.8 
 
 
314 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36462  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 
294 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  26.51 
 
 
293 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1115  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.95 
 
 
281 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
295 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 
293 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0501667  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  26.51 
 
 
293 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1294  glucose ABC transporter, permease protein, putative  27.24 
 
 
281 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
288 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
323 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  29.28 
 
 
283 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 
299 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
283 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
287 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.53 
 
 
277 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
289 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
308 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.88 
 
 
323 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208798  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>