More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3602 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
295 aa  591  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24640  carbohydrate ABC transporter membrane protein  82.84 
 
 
303 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.36 
 
 
299 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0966024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31520  carbohydrate ABC transporter membrane protein  51.49 
 
 
303 aa  286  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.424225  normal  0.830973 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1487  MalG-type ABC sugar transport system permease component  42.37 
 
 
288 aa  238  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210522  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0812  ABC-type maltose transport system, permease component  41.59 
 
 
215 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
275 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
285 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
277 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
294 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
294 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
271 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3249  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.33 
 
 
284 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
296 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
289 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
275 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2402  ABC transporter membrane spanning protein  30.57 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  27.05 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
281 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224694  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.1 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150437  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  31 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1115  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.96 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.66 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  30.74 
 
 
293 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4073  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.99 
 
 
285 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22339  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
285 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
285 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
285 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  31.16 
 
 
278 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  29.04 
 
 
303 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
304 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0067  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.45 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1294  glucose ABC transporter, permease protein, putative  34.59 
 
 
281 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  32.84 
 
 
285 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
303 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
320 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
277 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
273 aa  125  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.354113  normal  0.0704722 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
294 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00536554  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 
314 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  32.28 
 
 
278 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3449  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.54 
 
 
285 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000612368  normal  0.971019 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
285 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.71 
 
 
295 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
285 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  0.12069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8234  maltose transport protein  30.8 
 
 
271 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367769  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
297 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3573  carbohydrate ABC transporter permease  32 
 
 
279 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
279 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
280 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
293 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 
314 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4018  carbohydrate ABC transporter permease  32 
 
 
279 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
279 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290838  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
293 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.464389  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
273 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
272 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.56 
 
 
307 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.050978  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
299 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  33.91 
 
 
272 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
298 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.41 
 
 
275 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  30.56 
 
 
286 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
275 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  30.15 
 
 
293 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  32.1 
 
 
285 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
305 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290341 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  32.1 
 
 
285 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  32.1 
 
 
285 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  32.1 
 
 
285 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  32.1 
 
 
285 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  32.1 
 
 
285 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.15 
 
 
293 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  32.1 
 
 
281 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
294 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
308 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0501667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.709264  normal  0.405077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  31.16 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.76 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
284 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>