91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2005 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  175  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  85.39 
 
 		 90 aa  152  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  87.21 
 
 		 108 aa  152  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  89.53 
 
 		 90 aa  117  6e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  52.81 
 
 		 94 aa  103  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  56.18 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  48.84 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  47.19 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  47.19 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  46.07 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  47.19 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  47.67 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  46.51 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  48.84 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  44.83 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  43.82 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  46.07 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  41.86 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  40.7 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  46.51 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  40.7 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  37.78 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  48.28 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  40.7 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  39.53 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  39.53 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  47.67 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  39.53 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  40.7 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  41.38 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  37.21 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  40.45 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  41.86 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  37.08 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  39.53 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  37.93 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  39.13 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  34.48 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  41.86 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  35.63 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  45.24 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  36.05 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  29.07 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  31.82 
 
 		 400 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.13 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  31.17 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  37.66 
 
 		 316 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  33.72 
 
 		 398 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  37.5 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  36.99 
 
 		 327 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  30.11 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  36.36 
 
 		 324 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  31.17 
 
 		 317 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  36.36 
 
 		 404 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.97 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  35.62 
 
 		 325 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  41.67 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  30.77 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  28.89 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  35.06 
 
 		 316 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  33.9 
 
 		 429 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  33.33 
 
 		 404 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  29.07 
 
 		 398 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  33.33 
 
 		 404 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  27.59 
 
 		 406 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  36.99 
 
 		 173 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.56 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0223  formyl transferase domain-containing protein  31.17 
 
 		 289 aa  43.5  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  26.44 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  30.51 
 
 		 410 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  38.78 
 
 		 418 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.12 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2479  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.78 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.204447  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02138  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.88 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  38 
 
 		 418 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  33.93 
 
 		 411 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  36 
 
 		 412 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  30.56 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  36.62 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  44.9 
 
 		 189 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  28.17 
 
 		 405 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  36 
 
 		 429 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  31.52 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  27.78 
 
 		 404 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 		 405 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.17 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.58 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.3 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.3 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>