95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1840 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1840  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
127 aa  248  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1594  heat shock protein Hsp20  62.2 
 
 
113 aa  157  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.386135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0472  heat shock protein Hsp20  59.06 
 
 
115 aa  154  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00129647  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1648  heat shock protein Hsp20  59.06 
 
 
115 aa  148  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1810  heat shock protein Hsp20  45.35 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  45.35 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  46.58 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  30.13 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0907  putative heat shock protein  38.16 
 
 
175 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.606312  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
183 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0658  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  29.13 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  43.42 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
171 aa  52  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  26.04 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  26.04 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2547  putative heat shock protein  34.21 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.837495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  28.42 
 
 
169 aa  48.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2564  heat shock protein Hsp20  28.95 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0372  heat shock protein Hsp20  31.52 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  26.39 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  27.78 
 
 
191 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  34.57 
 
 
184 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  27.08 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  32.63 
 
 
171 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2605  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325564  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  35.82 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  31.4 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  25.36 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  31.31 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  25.36 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1892  putative small heat shock protein  39.71 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.249328  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0117  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104123  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1294  heat shock protein Hsp20  33.05 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  34.72 
 
 
183 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  31.46 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  24.51 
 
 
218 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  25.62 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  27.08 
 
 
147 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  26.09 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2323  putative small heat shock protein  30.59 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.814003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  25.58 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  27.08 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  27.94 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  28.41 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  23.96 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  24.06 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  23.66 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  27.78 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1294  heat shock protein Hsp20  27.07 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.770288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  32.98 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0504  heat shock protein Hsp20  30.1 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.5396  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  25.52 
 
 
161 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  29.55 
 
 
189 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0617  heat shock protein Hsp20  29.47 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.23773e-35 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  29.21 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1494  heat shock protein Hsp20  23.57 
 
 
148 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000082748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  23.66 
 
 
147 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  24.53 
 
 
189 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  29.67 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0298  heat shock protein Hsp20  25.17 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2807  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0373255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  28.41 
 
 
189 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3518  heat shock protein Hsp20  28.74 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  26.53 
 
 
204 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  21.8 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  25.61 
 
 
178 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3021  heat shock protein HSP20  29.33 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3173  heat shock protein Hsp20  27.63 
 
 
227 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.327314  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  26.61 
 
 
158 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  25.27 
 
 
164 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  25.27 
 
 
164 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>