71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0102 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000654219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0127  hypothetical protein  68.66 
 
 		 269 aa  380  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0384146  hitchhiker  0.00530729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0135  hypothetical protein  63.06 
 
 		 269 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1171  hypothetical protein  61.94 
 
 		 269 aa  350  1e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.51603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0757  periplasmic binding protein  42.86 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2214  periplasmic binding protein  32.33 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1584  periplasmic binding protein  31.47 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.409039  normal  0.308354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2460  periplasmic binding protein  30.54 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1104  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2093  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  24.1 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.839257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1518  periplasmic binding protein  39.24 
 
 		 315 aa  52.8  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2762  periplasmic binding protein  29.34 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.599111  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 379 aa  52  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2443  periplasmic binding protein  31.45 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000910512  normal  0.674129 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  28.89 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  25.73 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.03 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2167  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579619  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3896  periplasmic binding protein  25.52 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00316656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3569  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135513  hitchhiker  0.00885259 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  30.63 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2146  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.32 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.543136  normal  0.254057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  26.14 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1393  periplasmic binding protein  29.69 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310826  normal  0.0475326 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  30.63 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2169  periplasmic binding protein  29.84 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000287241  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  31.78 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3846  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.907593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3803  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  26.83 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.656087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  28.36 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  28.36 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  28.36 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3891  periplasmic binding protein  26.83 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0648  hemin-binding periplasmic protein  26.83 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  26.14 
 
 		 320 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  28.36 
 
 		 320 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  22.61 
 
 		 338 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  22.61 
 
 		 338 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  40.32 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  22.5 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  27.42 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  27.61 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2623  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  37.5 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  25 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  37.5 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  37.5 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.59 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  39.06 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  29.2 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.87 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.05 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4172  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0319081  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  29.31 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  28.07 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  25 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0726  periplasmic binding protein  37.31 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4706  periplasmic binding protein  34.26 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.05 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  29.31 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  26.05 
 
 		 517 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2532  periplasmic binding protein  29.77 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2784  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 303 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.151329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 325 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  32.39 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  29.32 
 
 		 723 aa  42  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>