231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4144 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 472 aa  954    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  42.26 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  41.23 
 
 		 464 aa  343  5e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  40.86 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  40.4 
 
 		 455 aa  319  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  42.59 
 
 		 455 aa  319  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  39.73 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  39.74 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  44.71 
 
 		 445 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  39.91 
 
 		 451 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  40.05 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  38.53 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  38.57 
 
 		 435 aa  276  5e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.26 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  37.1 
 
 		 468 aa  270  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  38.04 
 
 		 438 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  40.19 
 
 		 470 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.26 
 
 		 430 aa  267  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  35.49 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.25 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  36.1 
 
 		 475 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  36.77 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  37.41 
 
 		 391 aa  257  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.17 
 
 		 391 aa  257  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  37.06 
 
 		 449 aa  257  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  37.06 
 
 		 456 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  35.1 
 
 		 395 aa  256  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.41 
 
 		 391 aa  256  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  39.67 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  34.98 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.24 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.05 
 
 		 399 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  37.41 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  39.13 
 
 		 424 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  41.33 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  37.56 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.13 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.13 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.13 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.13 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.13 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  39.62 
 
 		 424 aa  249  8e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 388 aa  249  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.81 
 
 		 392 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  36.3 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.05 
 
 		 409 aa  249  1e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  38.86 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.52 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  35.63 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  38.63 
 
 		 388 aa  246  8e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  37.44 
 
 		 460 aa  246  8e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  35.08 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.27 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  34.98 
 
 		 408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  35.49 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  38.94 
 
 		 514 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.22 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.26 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.26 
 
 		 394 aa  243  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.95 
 
 		 389 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  38.63 
 
 		 392 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.95 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.95 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.95 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.26 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  35.79 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  34.46 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.16 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.42 
 
 		 389 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  35.27 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.94 
 
 		 421 aa  240  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.02 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  36.16 
 
 		 453 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.68 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.85 
 
 		 400 aa  239  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  39.18 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  39.47 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.85 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  36.51 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.66 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  38.02 
 
 		 399 aa  238  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.68 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  36.45 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.35 
 
 		 393 aa  237  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.8 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.53 
 
 		 398 aa  236  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  35.83 
 
 		 465 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  36.9 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.53 
 
 		 389 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.34 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  35.89 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  36.41 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.9 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.66 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>