292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3649 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  100 
 
 		 485 aa  1006    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  37.47 
 
 		 492 aa  332  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  37.03 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  38.17 
 
 		 493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  40.73 
 
 		 458 aa  312  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.41 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.27 
 
 		 485 aa  310  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  37.88 
 
 		 497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.93 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  37.19 
 
 		 470 aa  305  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  38.94 
 
 		 492 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  38.89 
 
 		 499 aa  289  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.11 
 
 		 493 aa  283  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  34.5 
 
 		 486 aa  282  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  34.5 
 
 		 486 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  34.5 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  36.87 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.68 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  34.5 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  38.21 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  34.5 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  39.9 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  34.5 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.5 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  34.5 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.16 
 
 		 505 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  37.88 
 
 		 503 aa  279  7e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  35.92 
 
 		 497 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  35.37 
 
 		 497 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.88 
 
 		 491 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  37.08 
 
 		 520 aa  277  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.92 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.92 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  37.75 
 
 		 491 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  36.47 
 
 		 493 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.66 
 
 		 505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.39 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  37.44 
 
 		 484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.32 
 
 		 506 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  36.88 
 
 		 491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.19 
 
 		 487 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  37 
 
 		 490 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.75 
 
 		 492 aa  273  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  34.49 
 
 		 500 aa  272  9e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  37.17 
 
 		 493 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  37.38 
 
 		 490 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  37.38 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  37.38 
 
 		 490 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  37.38 
 
 		 490 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.83 
 
 		 470 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  36.71 
 
 		 498 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  36.71 
 
 		 489 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  36.71 
 
 		 489 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  36.47 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  36.47 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  36.47 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  36.47 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  34.62 
 
 		 502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  37.15 
 
 		 490 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.25 
 
 		 528 aa  266  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  36.88 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  35.38 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.28 
 
 		 509 aa  264  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  33.97 
 
 		 491 aa  263  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  35.66 
 
 		 484 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  37.47 
 
 		 491 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  35.65 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.65 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.89 
 
 		 472 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  36.85 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.68 
 
 		 484 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  35.27 
 
 		 455 aa  257  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  33.58 
 
 		 497 aa  257  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  34.95 
 
 		 510 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  37.47 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  34.94 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.63 
 
 		 485 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.62 
 
 		 494 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  35.88 
 
 		 548 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.87 
 
 		 497 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.31 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  33.33 
 
 		 488 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  32.98 
 
 		 488 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3014  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.21 
 
 		 501 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.264666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4288  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.17 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.760127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  32.98 
 
 		 488 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  33.95 
 
 		 487 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  33.12 
 
 		 488 aa  249  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.12 
 
 		 488 aa  249  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  33.12 
 
 		 488 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.12 
 
 		 488 aa  249  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  33.12 
 
 		 488 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.52 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34 
 
 		 659 aa  248  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  32.77 
 
 		 497 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  36.75 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  34.86 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  33.98 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  33.04 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  34.95 
 
 		 492 aa  244  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.321146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>