More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3101 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  54.68 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.88 
 
 		 279 aa  308  8e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  53.24 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  52.52 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  52.16 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  52.52 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  52.52 
 
 		 279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  52.52 
 
 		 279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  52.52 
 
 		 279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  52.16 
 
 		 279 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  52.16 
 
 		 279 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  52.16 
 
 		 279 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  52.16 
 
 		 279 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  51.99 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  52.35 
 
 		 277 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.88 
 
 		 276 aa  301  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  51.08 
 
 		 277 aa  300  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.71 
 
 		 276 aa  291  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.92 
 
 		 275 aa  291  8e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  51.09 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  51.09 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  50.36 
 
 		 275 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  49.64 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  49.63 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  49.26 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  46.95 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  46.95 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  46.24 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  46.59 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  46.59 
 
 		 275 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  45.52 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  45.16 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  45.52 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  47.57 
 
 		 267 aa  241  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  43.68 
 
 		 275 aa  238  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  44.09 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  43.07 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  43.61 
 
 		 271 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  41.88 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  43.12 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  36.56 
 
 		 414 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  39.41 
 
 		 289 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  37.45 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  37.08 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  37.83 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  38.58 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  37.64 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  36.43 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  36.7 
 
 		 289 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  35.96 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  36.7 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  36.63 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  37.73 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  37.08 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  38.91 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  34.83 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  36.4 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  36.8 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  36.82 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  34.46 
 
 		 292 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  36.5 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  34.83 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  34.57 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  34.08 
 
 		 292 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  33.59 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  34.93 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  35.02 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  34.91 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  36.19 
 
 		 273 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  35.38 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  33.61 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  32.33 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  34.54 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  34.75 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  33.73 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  36.25 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  30.68 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  33.98 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  32.33 
 
 		 303 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  32.54 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.33 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  34.73 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  32.92 
 
 		 294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2839  MCP methyltransferase, CheR-type  31.72 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.40202  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  34.73 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  32.45 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  31.65 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  32.57 
 
 		 305 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  32.18 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  30.48 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  29.6 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  32.57 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>