93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2607 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 484 aa  995    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  43.42 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  40.23 
 
 		 494 aa  290  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  38.55 
 
 		 440 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  34.09 
 
 		 442 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  34.84 
 
 		 444 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  32.64 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  34.58 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  31.88 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  34.14 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  36.44 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  33.66 
 
 		 471 aa  210  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  35.61 
 
 		 504 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  32.78 
 
 		 499 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  37.07 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  32.21 
 
 		 383 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  38.34 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  36.58 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  32.98 
 
 		 386 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  33.55 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  35.63 
 
 		 372 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  32.36 
 
 		 386 aa  127  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  29.74 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  30.16 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  33.18 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  26.49 
 
 		 560 aa  67  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  39.22 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2840  hypothetical protein  27.84 
 
 		 728 aa  53.9  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  21.69 
 
 		 642 aa  53.5  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  26.25 
 
 		 462 aa  53.5  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  26.84 
 
 		 651 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  24.1 
 
 		 624 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  26.22 
 
 		 651 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  31.11 
 
 		 630 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  30.48 
 
 		 739 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  68.75 
 
 		 690 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  33.61 
 
 		 587 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  24.52 
 
 		 633 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  23.99 
 
 		 639 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  33.06 
 
 		 455 aa  50.4  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 658 aa  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  45.31 
 
 		 659 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  48.94 
 
 		 691 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  24.46 
 
 		 738 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2233  protein of unknown function DUF839  61.29 
 
 		 619 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  43.1 
 
 		 663 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  30.12 
 
 		 631 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  25.82 
 
 		 690 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  30.23 
 
 		 638 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01880  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0620903  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  25.56 
 
 		 625 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  30.49 
 
 		 626 aa  48.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  37.84 
 
 		 696 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  29.76 
 
 		 689 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  37.1 
 
 		 693 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  39.19 
 
 		 695 aa  47.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  22.88 
 
 		 667 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  29.92 
 
 		 821 aa  47.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  24.2 
 
 		 593 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  45.45 
 
 		 630 aa  47  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  24.2 
 
 		 593 aa  47  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  27.95 
 
 		 689 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  26.99 
 
 		 647 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  25.32 
 
 		 593 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  29.17 
 
 		 625 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  44.64 
 
 		 659 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  27.71 
 
 		 677 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  29.14 
 
 		 663 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  24.35 
 
 		 612 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  42 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  22.33 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  54.29 
 
 		 640 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  26.61 
 
 		 674 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  26.72 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  26.63 
 
 		 627 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  30.23 
 
 		 663 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000820  putative phosphatase  23.2 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0910792  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  38.6 
 
 		 718 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  28.57 
 
 		 694 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  25.47 
 
 		 647 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  35 
 
 		 641 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  28.24 
 
 		 638 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  42 
 
 		 726 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  40 
 
 		 628 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  27.82 
 
 		 629 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  44.74 
 
 		 755 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0694  hypothetical protein  40 
 
 		 667 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  26.28 
 
 		 634 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  44.68 
 
 		 704 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2027  hypothetical protein  24.67 
 
 		 685 aa  43.9  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  44.68 
 
 		 708 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  26.67 
 
 		 674 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  23.94 
 
 		 689 aa  43.5  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>