125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2546 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  56.48 
 
 		 537 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  61.99 
 
 		 524 aa  685    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  59.81 
 
 		 526 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  58.75 
 
 		 522 aa  641    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  100 
 
 		 517 aa  1086    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  59.74 
 
 		 524 aa  643    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  57.5 
 
 		 514 aa  633  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  53.79 
 
 		 508 aa  591  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  52.25 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  50.77 
 
 		 520 aa  555  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  49.43 
 
 		 528 aa  538  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  48.95 
 
 		 525 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  49.53 
 
 		 543 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  48.98 
 
 		 543 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  49.16 
 
 		 543 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  48.42 
 
 		 543 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  47.48 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  49.53 
 
 		 531 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  51.29 
 
 		 527 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  47.9 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  45.33 
 
 		 520 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  47.47 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  44.59 
 
 		 524 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  43.8 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  44.69 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  43.13 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  42.61 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  41.47 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  42.26 
 
 		 507 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  43.5 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  43.24 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  42.05 
 
 		 508 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  43.3 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  41.59 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  42 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  39.66 
 
 		 522 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  38.22 
 
 		 507 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  36.27 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  38.53 
 
 		 515 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  36.63 
 
 		 537 aa  352  7e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  35.48 
 
 		 511 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  37.69 
 
 		 510 aa  347  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  35.77 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 505 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  35.36 
 
 		 499 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  34.17 
 
 		 501 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.48 
 
 		 508 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  35.36 
 
 		 499 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  32.06 
 
 		 512 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  32.48 
 
 		 508 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.05 
 
 		 505 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  34.32 
 
 		 504 aa  243  7e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 538 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  32.28 
 
 		 529 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 538 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 538 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  34.73 
 
 		 499 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  30.96 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  30.85 
 
 		 498 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  33.49 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  35.01 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  28.87 
 
 		 538 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  33.07 
 
 		 505 aa  238  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  34.16 
 
 		 507 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  28.87 
 
 		 538 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  28.87 
 
 		 538 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  34.03 
 
 		 502 aa  237  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  33.48 
 
 		 507 aa  237  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  31.27 
 
 		 501 aa  237  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  32.86 
 
 		 511 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 502 aa  236  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  32.62 
 
 		 500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 497 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  31.77 
 
 		 492 aa  233  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.75 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  34.52 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  30.91 
 
 		 510 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  31.5 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  34.97 
 
 		 505 aa  231  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  31.2 
 
 		 496 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  31.71 
 
 		 500 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  29.4 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  35.08 
 
 		 505 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  31.65 
 
 		 494 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 505 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  32.49 
 
 		 497 aa  223  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  31.32 
 
 		 495 aa  223  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  30.84 
 
 		 506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  31.66 
 
 		 506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  30.92 
 
 		 509 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  31.46 
 
 		 537 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  30.74 
 
 		 502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  31.36 
 
 		 496 aa  220  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  30.89 
 
 		 498 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  29.41 
 
 		 504 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 740 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  32.51 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  32.62 
 
 		 499 aa  217  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>