More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2071 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  78.97 
 
 		 234 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1295  TatD-related deoxyribonuclease  78.54 
 
 		 234 aa  395  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1025  TatD-related deoxyribonuclease  78.63 
 
 		 236 aa  391  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609004 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  45.15 
 
 		 237 aa  224  7e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  41.05 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  41.52 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  34.58 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2067  TatD-related deoxyribonuclease  32.79 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  28.96 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  28.68 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  33.64 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  32.98 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  29.55 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  33.17 
 
 		 269 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  30.32 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  30 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  28.12 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  28.79 
 
 		 254 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  28.57 
 
 		 256 aa  92  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  29.41 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  28.52 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  28.35 
 
 		 265 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  29.02 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  28.17 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  28.85 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  27.8 
 
 		 254 aa  89  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  30 
 
 		 457 aa  89  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  29.3 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  29.73 
 
 		 256 aa  88.2  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2878  TatD-related deoxyribonuclease  31.58 
 
 		 246 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  28.4 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  30.77 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  30.26 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  28.74 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  28.35 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  28.51 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  28.98 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  30.08 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  29.72 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0006  TatD family hydrolase  27.27 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.637647  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  30.35 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  30.35 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  30.35 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  30.35 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  26.09 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  30.35 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  30.35 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  30.35 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  30.35 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  29.78 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  30.35 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  29.22 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  26.36 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  29.03 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0817  TatD family hydrolase  26.42 
 
 		 251 aa  85.5  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  26.19 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  27.49 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  31.53 
 
 		 287 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1100  TatD family hydrolase  27.73 
 
 		 251 aa  85.1  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0124  TatD family hydrolase  30.05 
 
 		 265 aa  85.1  8e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  29.51 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  26.29 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  28.02 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  30.77 
 
 		 606 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  28.02 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  26.29 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  25.6 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  31.98 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  30.63 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  31.53 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  30.63 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  28.82 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  30.63 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  27.98 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  28.35 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  30.63 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  28.06 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  31.08 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  28.57 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  29.65 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  31.08 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  27.09 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  28.86 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  29.37 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  27.24 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1885  hydrolase, TatD family  28.24 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16447  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  28.96 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  27.09 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  28.32 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  30.18 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  27.89 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0883  TatD family hydrolase  27.06 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  28.83 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  31.08 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  27.2 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  33.55 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  29.55 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  27.41 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  30.93 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>