More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1508 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  80.75 
 
 		 507 aa  853    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  78.56 
 
 		 501 aa  822    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  78.4 
 
 		 511 aa  828    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  81.75 
 
 		 515 aa  884    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  79.31 
 
 		 511 aa  822    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  79.92 
 
 		 509 aa  828    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 514 aa  1056    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 		 523 aa  622  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 583 aa  595  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0741  lysyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 		 575 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 504 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 578 aa  561  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 563 aa  561  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1559  lysyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 573 aa  555  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 562 aa  556  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4009  lysyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 571 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 567 aa  539  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 491 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 489 aa  502  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 510 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 493 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 489 aa  492  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 491 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 507 aa  481  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 494 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 494 aa  475  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  49.8 
 
 		 491 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 503 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 492 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 499 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 499 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 573 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 573 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 524 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 490 aa  461  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 510 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 489 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 509 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 573 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 495 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 631 aa  456  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 514 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 508 aa  458  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 511 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 504 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 505 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 505 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>