More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3956 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  843    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  96.61 
 
 		 413 aa  819    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  65.21 
 
 		 409 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  64.63 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  61.74 
 
 		 420 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  65.42 
 
 		 411 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  62.5 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  62.5 
 
 		 409 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  62.5 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  62.75 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  62.16 
 
 		 410 aa  524  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  62.25 
 
 		 409 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  61.12 
 
 		 415 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  60.6 
 
 		 407 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  59.85 
 
 		 407 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  56.72 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  61.44 
 
 		 236 aa  295  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  70.06 
 
 		 181 aa  276  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05376  conserved hypothetical protein  37.84 
 
 		 412 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.964155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0110  hypothetical protein  56.29 
 
 		 193 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  45.73 
 
 		 231 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1391  hypothetical protein  51.3 
 
 		 178 aa  183  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1605  hypothetical protein  51.3 
 
 		 179 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  43.44 
 
 		 232 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  42.86 
 
 		 235 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  40.44 
 
 		 250 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07139  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_4G03730)  43.4 
 
 		 499 aa  173  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  42.08 
 
 		 230 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  42.08 
 
 		 230 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  42.08 
 
 		 230 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  41.63 
 
 		 230 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  40.43 
 
 		 230 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  43.32 
 
 		 232 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  41.18 
 
 		 230 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  39.65 
 
 		 236 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  43.48 
 
 		 230 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  43.48 
 
 		 230 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  43.48 
 
 		 230 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  43.48 
 
 		 230 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  43.48 
 
 		 230 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  43.48 
 
 		 230 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  43.48 
 
 		 230 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  40.09 
 
 		 232 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  39.32 
 
 		 232 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  41.26 
 
 		 232 aa  160  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  38.63 
 
 		 232 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  42.79 
 
 		 233 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  42.17 
 
 		 230 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  41.18 
 
 		 230 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  37.77 
 
 		 236 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  39.01 
 
 		 237 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 		 234 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  38.1 
 
 		 248 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  36.04 
 
 		 236 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  36.87 
 
 		 240 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 234 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  37 
 
 		 222 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  37.44 
 
 		 223 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  36.96 
 
 		 229 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07470  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_2G05810)  35.02 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  33.01 
 
 		 247 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  33.01 
 
 		 247 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  39.5 
 
 		 234 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  35.02 
 
 		 229 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  35.02 
 
 		 229 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  33.76 
 
 		 229 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  37.28 
 
 		 235 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  35.86 
 
 		 229 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.06 
 
 		 248 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  34.36 
 
 		 221 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  34.8 
 
 		 223 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  33.97 
 
 		 248 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 		 251 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  31.65 
 
 		 227 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  35.19 
 
 		 220 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  34.73 
 
 		 229 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  32.21 
 
 		 245 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  36.14 
 
 		 230 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  32.54 
 
 		 246 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 		 232 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 		 230 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 		 244 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  31.13 
 
 		 252 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  32.92 
 
 		 235 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  30.67 
 
 		 223 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  29.76 
 
 		 251 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 		 191 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 		 227 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  31.9 
 
 		 241 aa  94.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  31.6 
 
 		 295 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  31.6 
 
 		 295 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  31.17 
 
 		 254 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  28.98 
 
 		 248 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  30.09 
 
 		 243 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  30.58 
 
 		 236 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  31.88 
 
 		 295 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  32.05 
 
 		 296 aa  90.9  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  29.82 
 
 		 244 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  31.69 
 
 		 235 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 		 237 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>