27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0110 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0110  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  396  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  60.48 
 
 
415 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  61.08 
 
 
409 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  60.48 
 
 
415 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  59.88 
 
 
415 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  59.88 
 
 
415 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  59.88 
 
 
409 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  59.52 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  58.08 
 
 
411 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  58.08 
 
 
420 aa  214  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  56.29 
 
 
413 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  56.89 
 
 
413 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  56.89 
 
 
409 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  54.1 
 
 
433 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  57.58 
 
 
410 aa  207  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  52.69 
 
 
408 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1391  hypothetical protein  52.47 
 
 
178 aa  192  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  51.16 
 
 
407 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  50.91 
 
 
407 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1605  hypothetical protein  51.23 
 
 
179 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05376  conserved hypothetical protein  39.36 
 
 
412 aa  150  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.964155  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07139  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_4G03730)  41.42 
 
 
499 aa  149  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.167964 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07470  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_2G05810)  38.69 
 
 
430 aa  111  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507136  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  31.62 
 
 
176 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  26.9 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  28.97 
 
 
143 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  37.21 
 
 
153 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>